En el año de 1989, se creó el órgano desconcentrado de la SCT, Puertos Mexicanos, el cual tenía entre sus objetivos principales los siguientes:

• Planear, programar y ejecutar acciones para el desarrollo portuario nacional.
• Proponer la delimitación de los recintos portuarios.
• Construir, ampliar y determinar las especificaciones técnicas del equipo marítimo y portuario.
• Promover y contribuir al equipamiento de los puertos.

Puertos Mexicanos se convirtió por primera vez, en una Entidad capaz de disponer con los recursos financieros que se generaban en los puertos, a través de la recaudación de derechos por el uso de infraestructura portuaria (puerto, atraque, muellaje y almacenaje), al tiempo que agrupó funciones de varias dependencias que tenían relación con los puertos, facilitando y simplificando de esta manera, los trámites a realizar por los usuarios.

Las acciones emprendidas por Puertos Mexicanos dieron pie a la reestructuración de los puertos del país, a partir de la promulgación de la Ley de Puertos en junio de 1993.

   Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos (en formato PDF).

   Ley de Puertos (en formato PDF).

   Reglamento de la Ley de Puertos (en formato PDF).