Por su ubicación, el puerto de Guaymas ha mantenido el carácter de un puerto regional con acceso marítimo nacional e internacional por el Océano Pacífico y el Mar de Cortés, con un amplia zona de influencia a los Estados de Sonora, Baja California Sur, Chihuahua y Sinaloa, así como el área geográfica del centro- suroeste de los Estados Unidos de Norteamérica.

Las ciudades más cercanas al puerto de Guaymas son Hermosillo a 117 km al norte, Ciudad Obregón a 132 km al sureste, y Nogales, a solo 400 km, la cual hace frontera con el estado de Arizona en los Estados Unidos.