El puerto se localiza a 1.8 km de la Carretera Federal 15 Guaymas-Arizona, la cual dispone de 4 carriles de alta resistencia, la cual forma parte del corredor CANAMEX. A 400 km hacia el norte de Guaymas, se encuentra la ciudad de Nogales, frontera con los Estados Unidos.

En el puerto nace el denominado corredor logístico Guaymas-Arizona, sin barreras naturales de consideración (puentes, pendientes muy pronunciadas, túneles etc.), lo cual representa una opción atractiva para el transporte multimodal entre países con litorales en el Océano Pacífico y el mercado del sur de los Estados Unidos y el norte de México, mediante la utilización de Ferrocarril Mexicano, S.A. de C.V. (Ferromex), Union Pacific (UP), Pacer Stacktrain, Burlington Northern Santa Fe (BNSF) y CSX, ofreciendo un servicio transcontinental, con capacidad a doble estiba.

Para este modo de transporte terrestre, los principales nodos identificados son la terminal intermodal del Puerto de Guaymas, el Puerto de Tucson y los puertos fronterizos de Nogales,Son y Mexicali,B.C.S. Estudios efectuados anteriormente, indican que prácticamente con la infraestructura existente, se estima la capacidad de la línea ferroviaria para soportar 14 trenes por día en ambas direcciones.